生物安全柜和洁净工作台在多个方面存在明显的区分：

首先，从功能上看，不仅能提供局部洁净的工作环境保障，还能过滤实验操作中产生的气溶胶，防止有害物质污染环境，给操作人员带来健康危害。而洁净工作台则主要利用空气净化技术实现局部洁净环境保障。

其次，从结构上来说，大部分洁净工作台的工作区域为正压，通过风机把设备顶部的空气通过过滤系统直接传输至工作区域形成气压，再从前窗排出。而生物安全柜的工作区域为负压，可以防止实验样本中的气溶胶从前窗逸散，其内部分别对经过工作区域的气流以及排放气流进行过滤。

在用途上，适用于无毒无害的操作对象，一般用于医院、生物制药、食品、医学科学实验、光学、电子、无菌室实验、无菌微生物检验、植物组培接种等需要局部洁净无菌工作环境的科研和生产部门。而生物安全柜则更偏向于有挥发性化学品和挥发性发射性核素的试验，特别是操作者需要采取保护措施的场合，如医疗卫生、制药、科研等进行细菌培养时提供无菌无尘安全的工作环境。

总的来说，生物安全柜和洁净工作台在功能、结构以及用途等方面存在明显的差异。在实际应用中，应根据实验的具体需求和条件，选择适合的设备以保障实验的安全和有效进行。